细胞鉴定(STR)相关问题解答
Q1:小鼠细胞STR匹配到其他细胞系,一定是错误细胞吗?
(1)有公开数据库数据:若匹配失败(相似度<80%),可判定为错误细胞系
(2)无公开数据:小鼠多为近交系(遗传背景高度相似),同品系细胞易相互匹配,需结合细胞形态、功能实验、特异性标记物(如流式检测CD抗原)综合验证
Q2:无STR位点信息的细胞如何鉴定?
A2:三步验证法:
形态学检查:显微观察生长特性与典型形态
种属鉴定:人/鼠细胞 → 用COI基因条形码测序(Cytochrome c oxidase subunit I)
其他物种 → 16S rRNA或ITS序列分析
功能标志物检测:免疫荧光/流式检测组织特异性蛋白(如神经元细胞测β-tubulin III)
分化潜能实验(干细胞)
Q3:原代细胞需要做鉴定吗?
A3:通常不需要。由于原代细胞传代次数较少,一般不会选择STR鉴定进行溯源。且来源于同一个体的杂细胞也无法通过STR鉴定来区分。因此鉴定原代细胞正确性和纯度常选择免疫荧光、流式等方法检测特异性marker。
Q4:做STR可以判断种属的交叉吗?
A4:能力有限,需结合其他技术
(1)若人源细胞混入大量异种细胞,峰图呈锯齿状杂峰,可直接判读
(2)若人源细胞混入微量异种细胞 ,通常不可见,需通过COI种属鉴定 + qPCR物种特异性基因辅助判定
(3)若小鼠细胞混入人源细胞,可检出AMEL等位基因异常,可直接判读
(4)若小鼠混入非人异种细胞,仅当污染量>15%时可能被发现,需要线粒体基因测序等辅助手段
Q5:为什么有的小鼠细胞做了STR鉴定,但却说只能鉴定出种属?
A5:这些小鼠细胞系的位点信息还未录入数据库,没有可以比对的数据,所以检测结果不能确定是哪个小鼠细胞系。虽然这些细胞经过小鼠STR基因检测,确实测出了位点数据,只能说明该细胞是小鼠细胞,并且没有掺杂人的细胞,STR鉴定只能起到确定种属的作用。
Q6:数据库中没有位点信息的细胞系可以做STR鉴定吗?做了有什么意义?
A6:人、小鼠细胞可以做。其他物种的STR基因在开发中。没有位点信息的细胞系做STR仍然是有意义的:
(1) STR检测可以起到鉴定种属正确性的作用。
(2)首次引入细胞时检测的STR位点信息可以作为今后的参考:在细胞长期培养后若发现细胞特性改变,可重新检测STR基因,与首次引入时检测的数据对比。
Q7:什么时候需要做STR鉴定?
A7:以下情况建议做STR鉴定
(1)当实验室引入新的细胞株,而供者未提供相关鉴定。
(2)当细胞经过较长时间培养,发现细胞形态、功能等特性发生较大改变。
(3)当怀疑实验室保藏细胞时发生错误标记时。
Q8:同一种细胞在不同细胞库的位点信息怎么不一样?
A8:细胞在漫长的传代过程中可能发生基因突变,因此不同实验室保存的细胞具体位点可能略有差异;另外,即使是同一个细胞库保存的细胞,在不同检测环境下也可能会有部分位点差异。所以包括ATCC、DSMZ、ECACC在内的大型细胞库,相同的细胞都可能会有位点差异。根据国际细胞鉴定委员会(ICLAC)制定的细胞STR鉴定标准,细胞系的匹配度≥80%时,认为它们具有相关性,即衍生于共同的祖先细胞。
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